MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782206

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014535	TTA	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014535	TACT	2	8	314	321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014535	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014535	TTA	2	6	360	365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014535	CAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014535	TTA	2	6	394	399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014535	TAA	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014535	GTTAGG	2	12	633	644	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014535	GGC	2	6	655	660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014535	C	7	7	779	785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_014535	T	6	6	823	828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014535	A	11	11	862	872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014535	AT	4	8	886	893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014535	ACA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014535	TAAAT	2	10	1018	1027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014535	TAA	2	6	1105	1110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
17	NC_014535	TAC	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
18	NC_014535	TAAC	2	8	1173	1180	50 %	25 %	0 %	25 %	307591244
19	NC_014535	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
20	NC_014535	AAT	2	6	1219	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
21	NC_014535	TCTA	2	8	1267	1274	25 %	50 %	0 %	25 %	307591244
22	NC_014535	TAT	2	6	1365	1370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
23	NC_014535	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
24	NC_014535	TAA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
25	NC_014535	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
26	NC_014535	T	6	6	1510	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	307591244
27	NC_014535	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
28	NC_014535	TAAA	2	8	1587	1594	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
29	NC_014535	TAGT	2	8	1628	1635	25 %	50 %	25 %	0 %	307591244
30	NC_014535	TCA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
31	NC_014535	TAG	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
32	NC_014535	TAA	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
33	NC_014535	AGT	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
34	NC_014535	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
35	NC_014535	CAT	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
36	NC_014535	GTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591244
37	NC_014535	ATTGTT	2	12	2071	2082	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	307591244
38	NC_014535	TAA	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
39	NC_014535	CATC	2	8	2195	2202	25 %	25 %	0 %	50 %	307591244
40	NC_014535	ATT	2	6	2290	2295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
41	NC_014535	CTT	2	6	2355	2360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
42	NC_014535	ATA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
43	NC_014535	CTA	2	6	2475	2480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
44	NC_014535	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
45	NC_014535	TCA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
46	NC_014535	AATT	2	8	2566	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
47	NC_014535	TCA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
48	NC_014535	TAA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
49	NC_014535	CTTG	2	8	2718	2725	0 %	50 %	25 %	25 %	307591244
50	NC_014535	ATA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
51	NC_014535	ATT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
52	NC_014535	CTT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307591244
53	NC_014535	GA	3	6	2989	2994	50 %	0 %	50 %	0 %	307591244
54	NC_014535	TAG	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
55	NC_014535	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
56	NC_014535	CCT	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307591244
57	NC_014535	ATA	2	6	3115	3120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
58	NC_014535	TGAAT	2	10	3137	3146	40 %	40 %	20 %	0 %	307591244
59	NC_014535	TCTA	2	8	3166	3173	25 %	50 %	0 %	25 %	307591244
60	NC_014535	TAAT	2	8	3174	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
61	NC_014535	T	6	6	3189	3194	0 %	100 %	0 %	0 %	307591244
62	NC_014535	CAT	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
63	NC_014535	TAG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
64	NC_014535	TGAA	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	307591244
65	NC_014535	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
66	NC_014535	AAAT	2	8	3379	3386	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
67	NC_014535	TCA	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
68	NC_014535	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	307591244
69	NC_014535	TAG	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591244
70	NC_014535	AGACA	2	10	3535	3544	60 %	0 %	20 %	20 %	307591244
71	NC_014535	AAAT	2	8	3575	3582	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
72	NC_014535	TAA	2	6	3645	3650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
73	NC_014535	TAA	2	6	3676	3681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
74	NC_014535	TAAA	2	8	3711	3718	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
75	NC_014535	A	6	6	3730	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	307591244
76	NC_014535	AT	3	6	3749	3754	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
77	NC_014535	AATATT	2	12	3763	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	307591244
78	NC_014535	T	7	7	3801	3807	0 %	100 %	0 %	0 %	307591244
79	NC_014535	TTAAA	2	10	3828	3837	60 %	40 %	0 %	0 %	307591244
80	NC_014535	TAA	2	6	3844	3849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591244
81	NC_014535	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591244
82	NC_014535	AAGA	2	8	4054	4061	75 %	0 %	25 %	0 %	307591244
83	NC_014535	ATT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
84	NC_014535	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
85	NC_014535	TAAA	2	8	4177	4184	75 %	25 %	0 %	0 %	307591244
86	NC_014535	TTA	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591244
87	NC_014535	ATCT	2	8	4364	4371	25 %	50 %	0 %	25 %	307591245
88	NC_014535	TTAA	2	8	4494	4501	50 %	50 %	0 %	0 %	307591245
89	NC_014535	AAT	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591245
90	NC_014535	TCA	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591245
91	NC_014535	ATC	3	9	4803	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591246
92	NC_014535	ATA	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591246
93	NC_014535	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591246
94	NC_014535	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014535	ATTT	2	8	4969	4976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014535	CAT	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014535	TAAT	2	8	5021	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014535	AATGA	2	10	5070	5079	60 %	20 %	20 %	0 %	307591247
99	NC_014535	CTA	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
100	NC_014535	AGTA	2	8	5147	5154	50 %	25 %	25 %	0 %	307591247
101	NC_014535	TAC	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591247
102	NC_014535	GAAA	2	8	5221	5228	75 %	0 %	25 %	0 %	307591247
103	NC_014535	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	307591247
104	NC_014535	ATA	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
105	NC_014535	CAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307591247
106	NC_014535	T	6	6	5378	5383	0 %	100 %	0 %	0 %	307591247
107	NC_014535	GTAT	2	8	5405	5412	25 %	50 %	25 %	0 %	307591247
108	NC_014535	TAG	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
109	NC_014535	A	7	7	5451	5457	100 %	0 %	0 %	0 %	307591247
110	NC_014535	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307591247
111	NC_014535	T	6	6	5477	5482	0 %	100 %	0 %	0 %	307591247
112	NC_014535	ATA	2	6	5494	5499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591247
113	NC_014535	GT	4	8	5512	5519	0 %	50 %	50 %	0 %	307591247
114	NC_014535	ATT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591247
115	NC_014535	ATG	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307591247
116	NC_014535	T	6	6	5683	5688	0 %	100 %	0 %	0 %	307591248
117	NC_014535	ATTTA	2	10	5840	5849	40 %	60 %	0 %	0 %	307591248
118	NC_014535	CT	3	6	5867	5872	0 %	50 %	0 %	50 %	307591248
119	NC_014535	A	6	6	5873	5878	100 %	0 %	0 %	0 %	307591248
120	NC_014535	TCA	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591248
121	NC_014535	TAAG	2	8	6176	6183	50 %	25 %	25 %	0 %	307591248
122	NC_014535	ATT	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591248
123	NC_014535	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
124	NC_014535	ACCTTT	2	12	6304	6315	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	307591249
125	NC_014535	TTA	3	9	6344	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307591249
126	NC_014535	GTT	2	6	6369	6374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591249
127	NC_014535	A	6	6	6382	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	307591249
128	NC_014535	T	6	6	6595	6600	0 %	100 %	0 %	0 %	307591249
129	NC_014535	GATAA	2	10	6657	6666	60 %	20 %	20 %	0 %	307591249
130	NC_014535	AAT	2	6	6765	6770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591249
131	NC_014535	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591249
132	NC_014535	TA	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014535	TAA	2	6	6978	6983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014535	T	6	6	6984	6989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014535	AATT	2	8	7009	7016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014535	ACA	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014535	GAT	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014535	TAA	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014535	ATAA	2	8	7201	7208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014535	TA	3	6	7217	7222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_014535	T	9	9	12933	12941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014535	G	7	7	13018	13024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014535	TAT	2	6	13033	13038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014535	GAT	2	6	13093	13098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014535	CTA	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_014535	ACCCTA	2	12	13156	13167	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_014535	CCTTAA	2	12	13197	13208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_014535	AGC	2	6	13262	13267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_014535	TCG	2	6	13283	13288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_014535	TAA	2	6	13448	13453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
285	NC_014535	TTG	2	6	13462	13467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307591256
286	NC_014535	TAA	3	9	13472	13480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
287	NC_014535	TAC	2	6	13486	13491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307591256
288	NC_014535	TAA	2	6	13519	13524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
289	NC_014535	AGTA	2	8	13526	13533	50 %	25 %	25 %	0 %	307591256
290	NC_014535	T	6	6	13537	13542	0 %	100 %	0 %	0 %	307591256
291	NC_014535	TAA	2	6	13551	13556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307591256
292	NC_014535	TA	3	6	13613	13618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014535	TA	3	6	13635	13640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_014535	TA	3	6	13756	13761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.